A EAJ/UFRN mantém convênio com a Federação dos Trabalhadores na Agricultura do Estado do Rio Grande do Norte – FETARN, desde o ano de 1999, formando técnicos em Agropecuária com capacitação voltada para a agricultura familiar nas condições existentes nas pequenas propriedades rurais do estado.
A clientela do curso é composta de jovens com Ensino Médio completo, que vivem no meio rural, filhos de agricultores familiares. Alunos formados por meio deste convênio contribuem para o desenvolvimento de agricultura familiar em suas próprias comunidades, através dos sindicatos rurais, EMATER/RN, ONG’s, entre outros envolvidos com Agropecuária, visando o desenvolvimento sócioeconômico e cultural desses agricultores. Da mesma forma, em convênio com o MDA/PRONERA/INCRA/UFRN/MST, no modelo da Pedagogia da Alternância, a Escola formou no ano de 2007, duas turmas de Técnicos em Agropecuária, cujos alunos eram oriundos de assentamentos rurais de várias regiões do Rio Grande do Norte.