Veja abaixo a composição da estrutura física da EAJ:

Setores administrativos

• Prédio da Direção;
• Secretaria Escolar;
• Alojamento Feminino;
• Alojamento Masculino;
• Semi-internato;
• Cozinha / restaurante;
• Ginásio Poliesportivo;
• Campo de futebol;
• Biblioteca setorial;
• Capela;
• Almoxarifado;
• Oficina mecânica;
• Marcenaria;
• Padaria;
• Auditório;
• Sede dos Servidores;
• Grêmio Estudantil;
• Unidade de Atendimento ao Educando;
• Prédio da Coordenação do e-Tec - Sobrado.

Setores pedagógicos

• Salas de vídeo;
• Salas de aula;
• Laboratórios de química;
• Laboratório de Agroindústria de leite, frutas e carnes;
• Laboratório de Informática;
• Laboratório de Eletrônica;
• Laboratório de Montagem e Manutenção de Computadores;
• Laboratório de Tecnologia em Análise e Desenvolvimento de Sistemas - TADS;
• Centro Vocacional Tecnológico - CVT;
• Prédio da Graduação;
• Sala de Dança/Educação Física;
• Salas para professores e coordenadores;
• Sala de Projetos;

Setores produtivos

• Pomar;
• Horta;
• Aviário;
• Centro de manejo de suínos;
• Centro de manejo de bovinos de leite e corte;
• Galpão de pesquisa para suinocultura;
• Abatedouro de animais;
• Estação de piscicultura;
• Cunicultura;
• Cotornicultura;
• Caprinocultura;
• Apiário;
• Casa de Vegetação;
• Gefor;
• Estábulo;
• Matadouro;
• Compostagem;
• Usina de beneficiamento de sementes, etc.

Total de área construída: Aproximadamente 30.000 m² (Dado de 2009)